Wrapping something should be in a paragraph. Hence critical part of your file should be (corrected in your file now):
\lipsum
\begin{wrapfigure}{l}{.525\textwidth} %this figure will be at the right
\includegraphics[width=.525\textwidth]{T vs R - tungsten filament.png}
\begin{center}
Figure 3
\end{center}
\end{wrapfigure}
%\lipsum
(Observe the position of `\lipsum).
BTW: Replacing all text \\
's by blank lines would help (La)TeX to correct dividing paragraphs into lines.
Edit New version:
$\,$
\begin{wrapfigure}{l}{.525\textwidth} %this figure will be at the right
\includegraphics[width=.525\textwidth]{T vs R - tungsten filament.png}
\begin{center}
Figure 3
\end{center}
\end{wrapfigure}
\lipsum
One way to set the \intextsep
globally, but only for the wrap figure
environemnt would be to use \BeforeBeginEnvironment
from the etoolbox
package.
\usepackage{etoolbox}
\BeforeBeginEnvironment{wrapfigure}{\setlength{\intextsep}{0pt}}
The before

and after the \BeforeBeginEnvironment
is applied:

Notes:
- In the MWE below I commented out your manual adjustment to
\setlength{\intextsep}{0.0pt plus 2.0pt minus 2.0pt}
.
- You can uncomment the
\showthe\intextsep
to see the effect.
- The
demo
option was used on the graphicx
package as I don't have the figures you were including.
Code:
\documentclass[11pt,a4paper]{article}
\usepackage[headheight=13.6pt,left=2cm,right=2cm,top=2cm,bottom=2cm]{geometry}
\usepackage[demo]{graphicx}
\usepackage{etoolbox}
\BeforeBeginEnvironment{wrapfigure}{\setlength{\intextsep}{0pt}}
\usepackage{quoting,polyglossia}
\setmainlanguage[spelling=new]{german}
\usepackage{unicode-math}
\setmathfont{xits-math.otf}
\usepackage{multirow,
tabularx,booktabs,array,
multicol,
wrapfig,float,subcaption}
\setlength{\multicolsep}{3.0pt plus 2.0pt minus 1.5pt}
\setlength{\floatsep}{0.0pt plus 2.0pt minus 2.0pt} %default: \setlength{\floatsep}{12.0pt plus 2.0pt minus 2.0pt}
\setlength{\textfloatsep}{0.0pt plus 2.0pt minus 4.0pt} %default: \setlength{\textfloatsep}{20.0pt plus 2.0pt minus 4.0pt}
%\setlength{\intextsep}{0.0pt plus 2.0pt minus 2.0pt} %default: \setlength{\intextsep}{12.0pt plus 2.0pt minus 2.0pt}
\usepackage[skip=2pt,figurename=Abb.,tablename=Tab.]{caption}
\usepackage[export]{adjustbox}
\captionsetup[figure]{font=footnotesize,labelfont=it}
\captionsetup[subfigure]{skip=2pt,font=scriptsize,labelfont=it}
\usepackage[compact]{titlesec}
\usepackage[inline]{enumitem}
\setitemize{noitemsep,topsep=2pt,parsep=0pt,partopsep=2pt,leftmargin=*}
\setenumerate{noitemsep,topsep=2pt,parsep=0pt,partopsep=2pt,leftmargin=*}
\newcommand{\arr}{$\rightarrow{}$}
\begin{document}
\begin{figure}[ht]
\centering
\includegraphics[frame,width=0.92\linewidth]{Path2-Pictures/3-6.png}
\caption{Basissymptome nach Kolsterkötter, 1992; 2012}
%\vspace{-0.5\baselineskip} --> a vspace I inserted before I set \intextsep to 0; this figure still has sufficient padding (why is unclear to me though)
\end{figure}
Diese Rückkehrhemmung ist bei Schizophrenen gestört \arr Aachen-Studien mit Covert Orienting of Attention Task; Gouzoulis-Mayfrank (2004, 2006, 2007): Gemessen wurde die RT beim Auffinden bestimmter Objekte an der alten Position \arr Schizophrene sind \emph{schneller}
Interpretation: Schizophrene können verschiedene Filter nicht anwenden, weshalb sie immer wieder auf basale Information zurückkehren müssen \arr Rückkehrhemmung bei Schizophrenen
\begin{wrapfigure}[7]{r}{0.3\textwidth}
%\vspace{-\baselineskip} --> this wrapfigure is now where I want it with \intextsep 0
\centering
%\showthe\intextsep% <-- uncomment to see the change
\includegraphics[frame,width=0.99\linewidth]{Path2-Pictures/3-8.png}
\caption{Moritz, 2006}
\end{wrapfigure}
\paragraph{Gedächtnisfehler \& Korrektheitskonfidenz} Studie von Moritz (2006): Bild wird gezeigt, dann entfernt; Frage: Erinnern sie sich an ...? Wie sicher sind sie sich?
\begin{itemize}
\item Gesunde Kontrollen waren sich nicht signifikant sicherer bei korrekten Antworten \arr gesehene Objekte erkennen bzw. nicht gesehene als solche bezeichnen
\item Schizophrene Patienten sind sich viel sicherer, wenn die Antwort \emph{inkorrekt ist} \arr signifikanter Unterschied
\begin{itemize}
\item Falsche Korrektheitskonfidenz \arr Gedächtnisfehler
\item Alles Nicht-Wahn Inhalte in Studie
\end{itemize}
\end{itemize}
\subsubsection{Basissymptome als Verlaufstest}
\paragraph{Hypothese:} Overinclusion als "symptomnahe Basisstörung" ist bei akuter Psychose besonders ausgeprägt \& wird im Verlauf schwächer \arr \textbf{Overinclusion:} Irrelevante Konzept-Merkmale werden integriert \arr Übereinschluss in Konzepte; Begriffe, Sachverhalte, Figuren, Schemata.
%\vspace{-0.8\baselineskip} --> this figure now is way too close to the text above with \intextsep 0
\begin{figure}[hb]
\begin{subfigure}{0.52\linewidth}
\includegraphics[frame,width=0.99\linewidth]{Path2-Pictures/3-11.png}
\caption{Maercker, 1987; Kawohl, 2010}
\end{subfigure}
\begin{subfigure}{0.47\linewidth}
\includegraphics[frame,width=0.99\linewidth]{Path2-Pictures/3-12.png}
\caption{Maercker, 1987; Kawohl, 2010}
\end{subfigure}
\end{figure}
\end{document}
Best Answer
Instead of using the
scale
option for\includegraphics
, you could usewidth
and select the same width that was declared for thewrapfigure
environment:Using the first optional argument, then you can even suggest the appropriate number of lines:
The
demo
option forgraphicx
simply replaces actual figures with black rectangles; do not use that option in your actual document.